XPRESSION底漆是一种革命性的标记的引物设计工具设计XPRESSION克隆实验。使用复杂的算法的XPRESSION底漆的标记引物的表达克隆,如网关的系统,BD在融合,抗原表位和TOPO工具的神器出山:www.shenqi73.com设计。
您可以选择放大整个ORF或产生N端或C端融合蛋白。 XPRESSION底漆确保扩增的ORF的阅读框架是保守的。为了与其他表达系统,只需将您的选择和设计标记的引物的功能标签。
为了确保您的PCR实验的成功,让XPRESSION引物设计嵌套标记的引物扩增开放阅读框。你可以找到任何地方的外引物中的非编码区或地区没有显着的同源性。 XPRESSION的底漆会爆你的序列,自动解释结果和设计具有高度特异性的引物。
标签的内引物对所产生很少或没有非编码区的外对的PCR产物进行放大。您也可以选择从列表中的备用引物,以更好地满足特定的实验需要。
多功能算法的XPRESSION底漆可以设计出最佳的测序引物在单次运行多个序列。它选择了在一个指定的时间间隔和反向引物扩增子引物跨越交错的相对链。您可以导出几个流行的孔板配置的结果。
以下是“XPRESSION入门”的一些主要特点:
标记引物设计
·优化设计引物对引物的设计数以千计的网关,BD-Fusion技术,TOPO和抗原系统或添加功能非常有用的标签,任何表达系统的设计引物。
·设计引物设计引物,成功地扩增巢式PCR的ORFs。的外引物的目的是在没有显着的同源性的区域中的非编码区。的内引物对进行放大所产生的外引物对的PCR产物。
·融合产品设计引物设计引物生成N和C端融合产品的功能有用的标签。
·迅雷不及掩耳之势:进程三百10kb的序列中约2分钟。
·保持阅读框:自动保持阅读框添加标签时要被放大的ORF。
·避免终止密码子:自动检查inframe终止密码子。
高通量底漆搜索
·算法:计算引物的Tm最近的邻居热力学算法。
·入门评分:只输出最受好评的引物对使用统计优化技术。
·综合搜索条件:引物筛选的热力学性质以及二级结构。
·统一的条件:在一个单一的统一的PCR循环条件下运行的搜索优化所有的引物。
测序引物设计
·设计引物:在一个用户定义的时间间隔之间的正向引物扩增产物测序引物的设计。反向引物东倒西歪,反对股。
数据和数据库管理
·项目:可以创建多个项目。多个实验数据可以很容易地通过创建单独的每个实验项目管理。
·应用程序数据库维护本地数据库序列信息和搜索结果。
Web集成·Web集成:快速检索批量的ORF序列,直接到程序中加入数字或GI号从Entrez使用。
输入/输出
·输入格式:支持序列与GenBank中,和FASTA格式。 ,GenBank和FASTA格式的文件可以包含多个序列,批次装载。
·输出:底漆搜索结果中可以查看和操作任何电子表格程序,如Microsoft Excel和Lotus123。
·负载输出:制表符分隔的输出文件格式,可以很容易地加载到任何数据库。
要求:
·CPU奔腾III
RAM 256 MB的可用内存
·硬盘驱动器的可用硬盘空间500 MB
·屏幕分辨率为800 X 600
限制:
·充分体现了每一个功能和功能的产品,但仅限于提供的样本数据。