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msatcommander 0.8.2软件简介

定位微卫星重复,设计位点特异性引物和标签

msatcommander是一个有关href="http://www.shenqi73.com/get/Programming/Coding-languages-Compilers/Python.shtml">的Python 的书面定位微卫星(SSR,VNTR,及c)重复FASTA格式的神器出山:www.shenqi73.com序列或共识文件内。 msatfinder将搜索所有的二,三,四,五,和六核苷酸重复序列(与选项较少重复的重复类型的类型和组合,以搜寻)。

给msatcommander一试,以便充分评估其能力!

下面是一些主要特点“msatcommander”

·为所有的单 - ,二 - ,三 - ,四 - ,五 - 和六碱基重复检索数据
·重复可以跨用户指定的距离(沸点)相结合
·设计引物为位于重复
·标签和测试与M13R性胃炎,慢性萎缩性胃炎,或自定义标记的引物。 '最好'的引物被报告给用户
·添加GTTT辫子未标记的,'最好的'引物向用户报告
·为广大用户提供了一个方便的GUI
以csv格式输出结果,便于输入到电子表格软件

此版本中的新功能:

·固定的问题,偶尔不当的治疗重叠的基地顺便说一句。引物和标签
·固定的问题与引物结合位点选择不当,重复区域使用自定义错配文件
·改变底漆产品尺寸定义(150-450基点)
·GTTT“小辫子”的非标记的引物(见Browstein等人1996年在参考文献的能力)
·到版本1.1.4更新的引物
·更新后的代码在这两个平台上工作与Python 2.5
·减少大小的二进制文件

随便看看

软件简略信息
  • 软件大小:5.57 MB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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