SAMMate 1.0测试版2.3_SAMMate 1.0 Beta 2.3下载地址

过程SAM文件与该应用程序。

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SAMMate是一个方便，易于使用的工具，专为快速处理SAM文件自动执行某些RNA-Seq数据分析的标准程序。 SAMMate使用标准的或定制的注释文件，使用户能够准确地计算出任何基因组的神器出山:www.shenqi73.com时间间隔短的阅读覆盖。特别地，对于RNA-seq的数据，SAMMate准确计算基因表达丰度分数的任何定制的基因组间隔通过使用短读取源于个外显子和外显子 - 外显子路口。

SAMMate也快计算的全基因组的信号的基极 - 明智的分辨率，这是所需要的输入的生物信息学的问题解决的数组的地图。 SAMMate出口扭动对准在UCSC基因组浏览器的可视化文件和取向的统计报告。 SAMMate是兼容的单端和双末端测序技术。

下面是一些主要特点“SAMMate”：

·计算基因组功能丰富得分RNA-Seq数据
·发电机峰值检测信号图
·扭动文件生成的可视化
·生成校准报告
·自定义基因注释文件
·自定义染色体的输出文件的名称