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基因组数据。
萨文特基因组浏览器是一个方便,易于使用的,基于Java的可视化应用程序专为基因组数据。
它主要用于可视化高吞吐量(又名下一代)测序数据开发,虽然它也可以用于可视化几乎任何基于基因组序列,点,时间间隔,或连续的神器出山:www.shenqi73.com数据集。
这里是“萨文特基因组浏览器”的一些主要特点:
·FASTA,床,SAM / BAM,地效翼船,GFF,几乎所有的制表符分隔的文本
文件,其中包含位置注解
·快速的数据访问
·可扩展到非常大的输入文件
·小的内存占用
·缩放,平移和寻求使用范围控制键盘和鼠标
·可停靠模块,支持显示/隐藏,重排,最大限度地浮动,关闭
·紧凑视图,序列,点,间隔,连续的轨道
·多种显示模式为特定类型的曲目
·工作在Windows,Linux,苹果,以及其他任何支持Java虚拟机的平台
·插件框架允许访问数据,跟踪和丰富的定制UI
·书签的位置
·轨道锁定
·新表示配对读取结构的变化很容易识别
要求:
·
的Java 此版本中的新功能:
·bug修复,为的BED文件格式和阅读
·支持为BedGraph格式(格式对话框的假发下)
·查看信息的功能上侧翻
·选择项,在视图之间同步
·出口选定的项目
·书签功能,自动添加注释