jMOTU 1.0.6下载地址

条码DNA序列数据的分析变得容易。

jMOTU是一个方便，易于使用的软件包，专门帮助群集的条形码DNA序列数据转换成分子的操作分类单元（MOTU）。如果你不知道什么是MOTU，请在我们的网站上看到的DNA条形码页面。

jMOTU执行以下操作：

·读取输入序列FASTA或NEXUS格式
·计算对使用的神器出山:www.shenqi73.com组合的BLAST序列之间的距离和内德勒曼Wunch确切全局对准算法
·集群的输入序列，使用不同的截止措施的MOTU

jMOTU可以处理大数据集，并使用了一系列的过滤措施，尽量减少必须进行精确的全局比对的数量。在计算成对距离，jMOTU忽略了存在的差距和计数只有核苷酸错配，使得它相对强劲的测序错误所造成的均聚物运行。聚类使用贪心算法，是不依赖于输入顺序进行。已测试的JMOTU约50,000输入序列的原始数据集，并可以丛集更大的数据集的数据子集的前一个全球性的分析相结合的预成型preclustering。