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WPDB数据库加载器2.0_WPDB Database Loader 2.0软件简介

分析生物大分子三维结构的快速和容易。

WPDB数据库Loader是一个方便,易于使用的工具,专门帮助你审问生物大分子的三维结构,发现在蛋白质数据银行(PDB)使用查询和显示工具,如上面显示的。

下面是一些主要特点的神器出山:www.shenqi73.com的“WPDB数据库加载程序”:

科学:
·基于对文本结构和序列搜索(不匹配)。
·根据Needleman和Wunsch(JMB 48(3):443-453,1970)的方法,对多个靶序列的一个寄存器序列的序列比对。
·结构叠加根据亨德里克森(鐗CrystA35 :158-163,1979的方法,使用Calpha位置。
·二级结构的分配根据的Kabsch和Sander方法。
·氨基酸的性能分布分析,静态和动态两种:静态根据编制的Bogardt等的值。动态的,平均暴露根据李和理查兹(JMB 55:379-400,1971)和实验乙factorsProfiles的一个单一的两个对齐的多肽链多肽链或不同的配置文件进行审查。
·联系在不同的距离,不同的原子团在contactSingle结构或叠加的结构(区别接触地图)的地图分析,可以检查。
·典型的3-D可视和渲染,包括选项,以显示或突出显示的子结构,CPK表示,立体声及简单曲面(彩色根据用户的距离)。
·几何计算键长,键角,二面角,非保税密切接触,包括图形表示和小分子距离的偏差。

计算:
·数据编程 - 有关在存储PDB ASCII文件分发降低了20倍,但有:(一)仅限于作者和JRNL记录的书目信息;(ii)任选的第一个或所有成员的合奏NMR或模型结构;(iii)只有第一种选择的构象的晶体结构与部分占用的部分PDB文件中定义的;(四)原子坐标舍入为2而不是3位小数;(五)没有PDB REMARK记录。
·可互操作的显示对象 - 当一个功能被选中的一个显示器的对象(e.ga联络图),其他所有可见的显示对象(e.g3-D浏览器)和所援引随后也将被更新,以说明该功能。
·直接的访问Raswin流行的分子显示程序。
·同步打印的文档和上下文相关帮助创建使用DocToHelp包。

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软件简略信息
  • 软件大小:255 KB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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