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砂光机是AMBER模块进行能量最小化,分子动力学和核磁共振改进的。的缩写,代表模拟退火的NMR所产生的能量约束,但这个模块是用于各种模拟,什么都没有做NMR细化。
砂光机使用的神器出山:www.shenqi73.com名称列表来控制它的最小化和动态参数。 NAMELIST提供了列表式输入,便捷的规范的默认值。
桑德8个作业控制是一个Java编写的程序,以协助编制的输入任务控制文件桑德-8。它采用直观的控制砂光机运行设置作业控制变量的。在许多情况下,而不是变量的名称,它使用变量的描述。例如,对于变量NSTLIM使用“MD步骤(nstlim)”的。
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