MetaSim 0.9.5下载地址

产生合成的读取与此应用程序的集合。

MetaSim是一个有用的工具，以帮助您生成合成读取集合，反映了典型的宏基因组数据集的不同分类组成专门设计的。

基于给定的基因组数据库，该程序允许用户设计一个宏基因组由指定本在NCBI分类的神器出山:www.shenqi73.com不同层次的，基因组的数目，然后收集从宏基因组中读取使用的数量不同的测序技术的模拟。

一个人口采样器可以产生源基因组和一个给定的进化树的基础上发展的序列。产生的数据集可以使用标准化的测试方案规划测序项目或基准汇编和宏基因组学软件。

下面是一些主要特点“MetaSim”：

·集成了源基因组序列数据库
·产生集合成读或配偶对基于适应性强的测序误差模型（如桑格化学，罗氏454，Illumina公司（原公司Solexa）
·使用户能够配置丰度值，为每个生物体模拟特定的分类单元的组合物
·提供了一个人口采样生成源基因组的基础上演变序列和进化树
·可通过图形用户界面或命令行模式控制

要求：

·的Java

此版本中的新功能：

·修正了在命令行模式：新的选项的桑格设置与设置的队友对概率。