DNA序列查看器与注释工具
在阿尔特弥斯的应用程序的开发是一个自由的基因组浏览器和注释工具,它允许范围内的序列序列特征的可视化和分析的结果,也是它的六帧转换。
它可以读取EMBL和GenBank数据库中的神器出山:www.shenqi73.com条目或序列FASTA或RAW格式。其他的序列特征可以在EMBL,GenBank或GFF格式。
需求:
路
的最新版本的Java Runtime v1.5或更高版本 此版本中的新功能:
路现在可以在命令行使用的JVM userplot选项,例如添加用户图艺术Duserplot / pathToFile / userPlot和多块,这是逗号分隔的艺术Duserplot ='/ pathToFile/userPlot1 / pathToFile/userPlot2,它也可以读URL的情节。
路增加了支持是能够读取BAM
文件显示读取的路线。它采用皮卡尔(http://picard.sourceforge.net/)的BAM文件中读取,所以需要阿尔特弥斯与Java 1.6中运行。
现在可以通过配置路,所有图表,绘制成折线图或热图。新增支持BLAST表格格式(-M选项)和MSPcrunch格式,情节分数。
路新增支持扭动(variableStep / fixedStep)图可以显示直方图或热图。
路增加了一个新的用户图形文件格式,第一列指定的基准位置。
路更多的配置选项已被添加到图形,使配置的图形线条样式和大小。
路页转到目录选项添加到“文件管理器”...