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RapidShapes是一个运行时的启发式方法来加快计算累计形状的概率。 RNA形状的抽象映射结构域树的形状,保持邻接和嵌套的结构特征,但不计螺旋的长度。
形状抽象集成与动态规划算法,因此它可以应用在结构预测,而不是事后。这避免了指数爆炸,仍然可以给我们一个非启发式和完整的神器出山:www.shenqi73.com帐户分子的折叠空间的属性。
RNAshapes在一个单一的软件包中提供了三个功能强大的RNA分析工具:
- 计算的一小部分代表不同形状的结构,完成一个明确的意义。
- 计算累计形状的概率。
- 比较的共识结构的预测,到过昂贵的Sankoff的算法作为一种替代。
上一个软件:jPREdictor 1.23
下一个软件:seqMINER 1.2