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计算机程序执行的形态模型的拟合

WH是一个计算机程序进行装修的形态模型，该模型的拟合质量进行测试。形态模型被称为分离模式，和是没有基因流。通过比较DNA序列数据，每两个密切相关的物种，该方法允许的时间，因为祖先的形态和大小的估计。

的神器出山:www.shenqi73.com隔离模型假定以下：
- 来自一个祖先，或人口，有一段时间，T代，在过去的两个物种，种群，已采样的数据，。
- 共同祖先的物种或种群是恒定的有效尺寸NA。
- 两个子代物种（群体）具有恒定的有效体积分别为N1和N2，。
- 除了在时间t的人口分离的时刻，人口的大小是恒定的。
- 由于人口的分离，是零的品种（群体）之间的基因流。
- 所有的基因突变是中性的。

应该驻留在同一文件夹中的数据文件，或由操作系统自动搜索文件夹中的程序文件。可以使用命令行参数运行程序，只需键入该程序的名称（WH）。如果不使用命令行参数，程序要求的运行参数的值。

用户启动程序只是简单地存在的数据文件所在的文件夹，输入该程序的名称（例如，“网站”），然后按回车键。该计划要求的数据文件和所需的分析的几个问题。几乎所有的命令和选项，也可以使用命令行参数输入。

程序可以被启动或在命令行的指令，而无需使用。
如果没有命令行指令 - 只需键入'WH'的提示。该计划将要求的基本信息。

在PowerPC上的程序图标，点击打开一个小窗口，在其中可以输入命令行参数。用户还可以只按回车键在这一点上，程序会要求运行参数。

命令行参数：

类型，并输入

WH-d'datafilename指定' - r'resultsfilename' - N'numsims“L'ldtype A'ranseed”

在哪里：

“datafilename”是在同一文件夹中的程序的数据文件的名称是

'resultsfilename'是包含结果将要创建的文件的名称。会产生结果文件名是'。WH'

'numsims'是一个整数的数目要运行的模拟。基本模型拟合不需要模拟。如果此值不为零或空白，数据文件必须有必要的信息，重组率。

“ldtype告诉程序是什么类型的连锁不平衡值计算。此选项需要做模拟，而且该数据文件包括对重组的信息和观察到的LD值。 “ldtype必须对应措施的连锁不平衡产生的数据文件。

'ldtype'可以取以下值：
'R'调用的相关系数
'S'调用R ^ 2，相关系数的平方
'D'调用基本配子的不平衡测量值d
'P'调用的D'，这是等于D / Dmax的，其中，Dmax是给出的D所观察到的等位基因频率的最大可能值。
'B'调用的D的绝对值| D |

“ranseed'是一个随机数种子，一般不要求，除非用户希望完全重复模拟。