FASTML 2.02下载地址

程序计算祖先的氨基酸序列的系统发育树

FASTML是一个程序来计算的祖先的氨基酸序列的系统进化树。

的用途：
FASTML使用标志的命令行参数：

如需帮助，请键入“fastml.exe-H”
-S seq.aln的神器出山:www.shenqi73.com顺序输入文件名。
-T tree.txt输入树的文件名（Newick格式）。
该程序会自动识别这些序列格式：Molphy，FASTA，PHYLIP，马斯，用Clustal，或Nexus。

使用-m选项来选择模型。以下机型的支持（氨基酸）：DAY，JTT，REV，CPREV，WAG，JC。核苷酸，目前只有JC模型的支持。默认的模式是的JTT。