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距离串联重复树重建算法

DTscore应用程序的开发是基于串联重复树重构算法的距离。它是基于一个简单的串联重复模型，该模型假定不平等的重组（交叉）作为唯一的复制机制。

它作为输入的所有副本之间的神器出山:www.shenqi73.com距离矩阵。在此矩阵中，行和列作为副本的轨迹排列的，需要以相同的方式排列的。 DTscore可以适用于比较大的数据集（一百多份）。

距离可以使用程序，如DNADIST（碱基序列）或PROTDIST（蛋白质序列）从PHYLIP包计算。站点之间的取代的异构率可以处理使用的GAMMA方法，例如