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GZ-γ_GZ-Gamma软件简介

估计的预期数量的替换每个氨基酸位点

预期数量的替换每个氨基酸(核苷酸)的网站,和伽马率点之间差异的形状参数估计,使用祖先的的顺序推理和最大似然估计相结合的

GZ-γ的系统发育这些同源序列的关系是已知的。

此套件包含两个项目:GZ-aa.exe的神器出山:www.shenqi73.com氨基酸序列,并在C语言编码的DNA序列,这是GZ-DNA.exe。要使用的程序,你需要一个输入文件含有氨基酸(或核苷酸)序列和这些序列(见atp6.aa的一个例子)的树的拓扑结构。此文件的开头两个数字序列和氨基酸或核苷酸位点(序列长度)的数目的数目。

将第二行的第一序列的名称,将第三行的第一序列,并依此类推。每个序列占据了线,没有任何中断。只有字母(大写)为20个氨基酸(或4个核苷酸)被允许在序列。的间隙或任何其它符号应该已经被移除。该文件的最后一行是树的拓扑结构的序列。

树格式PHYLIP包中所用的是相同的。注意该树无根,所以硝化而非bification的所需的最深的分支节点

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软件简略信息
  • 软件大小:133 KB
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  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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