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减少是一个方便,易于使用的应用,专门设计来帮助您添加氢到蛋白质数据库(PDB)的分子结构文件。
氢被添加在标准化的几何与优化的方位,OH,SH,NH 3 +,methyls蛋氨酸,天冬酰胺和Gln侧链酰胺,以及他的神器出山:www.shenqi73.com环。这两种蛋白质和核酸可以被处理。
HET基团也可,只要处理的原子连接设置。下面提供一个稍作修改的版本的连接表公布的PDB。需要注意的是HET字典可在两个“口味” - 新的和旧的(再次)。使用哪一个取决于你想要的输出时减少PDB