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探头是一个小的命令提示符下的应用程序,使用户能够评估之内或分子间的堆积,。
它产生的原子有密切接触的“接触点”。探头读取原子坐标从蛋白质数据库(PDB)格式的文件,将点列表列入在kinemage文件。
另外,可以量化和包装信息显示在表中列出的神器出山:www.shenqi73.com分数为范德华相互作用,氢键和原子重叠(“冲突”)。
本质上的逆的康诺利算法,该方法是将一个非常小的探针(通常半径为0.25A)的点沿所选的一组原子的范德华表面,并确定,如果该探针还接触在一秒钟内的原子“目标“进行设置。
探头提供了一个灵活的方法来选择源和目标原子沿改变探针半径和点密度的命令行标志。此外,探头可以产生一组原子(“自点”),甚至“面点”有没有附近的原子内的接触面