用Java编写的一个小工具,序列聚类分析。
通常情况下,同源性为理由,从已知到未知的蛋白质功能和结构知识转移。虽然系统发育是试图确定同源性的方法的选择时,最常用的标记是成对的序列相似性。
在多个微阵列实验发现共调控基因组的
神器出山:www.shenqi73.com问题是在一个大的数据集同源蛋白质组发现的问题非常相似。在这两种情况下,我们有大量的数据,并正在寻找某种显著相似的基因。
假定的共同监管以及公认的同源性,一般推断出相似的基因的功能设置。在第一种情况下的功能集包括整个实验中,在第二种情况下的氨基酸序列的蛋白质的表达水平。
有一定的相似性也很明显,当你看的蛋白质序列数据或微阵列数据生成的图表。 CLANS,并把它旋转,看看它实际上可以为你做!需求:
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