分析基因组关联研究使用此工具。
GS2是一个小的,简单的应用程序,专门设计来帮助你分析和可视化的全基因组关联研究。
效率,高通量的单核苷酸多态性(SNP)基因分型技术的最新进展,现在经常进行全基因组关联研究与温和的复杂疾病的遗传效应,我们预计需要检测的样本规模。
这里是“GS2”的
神器出山:www.shenqi73.com一些主要特点:
·轻松导入数据集的大规模的基因分型数据。目前支持的格式是标准的PED / dat
文件,床形式和人类基因组单体型图型文件。
·根据用户指定的阈值进行质量控制。
·安排项目为基础的结构数据集的进度跟踪分析,例如分层,不同的质量控制阈值或生物注释和功能的基础上为您的数据创建单独的子集。
导出您的数据的子集到不同的数据格式,用于运行其他外部分析和共享你的结果和数据。
解释你的数据在相关的情况下,通过将生物注释,如UCSC基因组数据库中的信息。
·使用基因的本体来选择标记注释的分子功能,细胞定位和生物过程中的关键字,通过搜索。
·探索连锁不平衡的模式,使用内置互动的计算和可视化功能。
·集成的方法计算的基本统计资料,并执行关联测试。
·以二进制格式保存整个项目。其优点包括多个数据集封装成一个紧凑的光盘上的文件,需要更小的
空间。
·剧情的原始基因分型的强度
要求:
·
的Java