Prodar 1.4下载地址

搜索PDB文件的候选蛋白质结构比对

Prodar，也被称为是建立一个搜索工具，用于查询的候选结构比对PDB蛋白质雷达。

输入到搜索是一种蛋白质的主链结构，从一个标准的PDB文件（文本），并把结果返回读取仅仅基于骨干，但无任何关于序列信息的神器出山:www.shenqi73.com结构相似性。

prodar标识部分匹配，查询结构的一个相对较小的部分，使得可以在PDB中对其他结构的部分相匹配的链的相对大小无关。

我们的目的是，该工具会自动识别常见的结构域，在其他不同的蛋白质结构。然后可以在结构排列在不同的工具，找到一个RMSD（Prodar只是提出建议）。