基于Java的Cytoscape的的SBML插件
的CySBML的插件的的Cytoscape的的设立是为了帮助您导入,与Cytoscape的的SBML文件中。在网络环境下,可以被看作SBML注释。
SBML模型可以导入文件和URL。此外,点击进入注解资源。
下面是一些主要特点“CySBML”
·基于Java的
神器出山:www.shenqi73.com解析器,Cytoscape的基于在Java SBML库JSBML SBML
·简单的访问SBML模型和SBML通过南方模式生物和仪Web服务注释
·支持所有版本的SBML
·支持SBML布局包
·支持的的SBML定性模型包装
·提供SBML验证(SBML警告和错误的访问)
·创建标准的的SBML种类/反应模型的基础上的网络布局
·提供基于RDF的注释信息在网络环境中
·基于导航菜单的SBML结构上与布局和注释信息
·成功测试的所有SBML.org和Biomodels.org测试用例(SBML测试情况下,BioModels_Database-2.0.2-R21-sbml_files的)
要求:
·
Cytoscape的 ·
的Java 此版本中的新功能:
·的布局bug修复(宽度和高度)
·解析的动力学信息节点的属性