VPLG 2012年10月11日测试_VPLG 2012.10.11 Beta下载地址

计算和可视化蛋白质图

的

VPLG，或蛋白质 - 配体图的可视化是一个工具，它使用基于图的模型来描述的结构，蛋白质的超二级结构。

图计算的一种蛋白质 - 配体原子的坐标，PDB文件和二级结构的DSSP算法的神器出山:www.shenqi73.com分配。

在该曲线图中，顶点表示的二级结构元件（SSE的，例如，通常是α-螺旋和β片）或配体分子而边缘模型的接触和在它们之间的空间关系。

VPLG是用Java编写的，使用的是Apache蜡染库SVG输出，并可以在多个平台上运行。

下面是一些主要特点“VPLG”：

·读取3维的的原子数据从PDB文件和二级结构分配DSSP文件
·计算一个图的蛋白 - 配体从数据和可视化的图形
·支持在位图中的图形图像（。png）该和向量（。svg的）格式的输出
·出口的蛋白质 - 配体在其自己的格式（PLG），很容易与计算机程序编辑，解析和生成一个纯文本文件中的图表
·可以读取和直接可视化蛋白质图表。PLG文件

要求：

·的Java