SnpSift 1.8下载地址

轻松操作VCF文件从CLI

SnpSift是一个简单的和可访问的工具，可以帮助您处理变量调用格式文件（VCF）的集合。

SnpSift的目的是使用Java编程语言，并可以运行在所有主要的操作系统。

下面是一些主要特点“SnpSift”：

·过滤器：您可以使用任意表达式来过滤，例如“（QUAL> 30）|（存在INDEL）|（countHet 2）”。实际的神器出山:www.shenqi73.com表现形式可以是相当复杂的，所以它允许了很大的灵活性。
注解：您可以添加从另一个数据库中的'ID'（例如，从dbSNP数据库的变种）
·病例对照：许多变体是如何在“案例”和“控制”组中，您可以比较。此外，还计算p值（Fisher精确检验）。
·TSTV：颠换比计算跃迁。
·时间：过滤器变种相交的时间间隔。
·RmRefGen：删除参考基因型（即替换“0/0”型的'。'）

要求：

·的Java