BisSNP 0.80下载地址

Bisulfite-seq/NOMe-seq个SNP位点胞嘧啶甲基化的来电

BisSNP专门开发作为一个有用的工具，是基于基因组分析工具。

BisSNP使得无论是手动指定或自动估计的甲基化的概率不同的胞嘧啶同时确定基因型和甲基化水平的上下文使用贝叶斯推理。

BisSNP是一个软件，可以为单端与双端读取。 BisSNPis在Java编程语言开发。

下面是一些主要特点“BisSNP”：

·呼叫和总结甲基化的神器出山:www.shenqi73.com胞嘧啶情况下（CPG，CHH，GCH等人，CHG）;
·准确变异检测。启用呼吁在亚硫酸氢盐测序的基本质量校准和插入缺失;
·在UCSC基因组浏览器和IGV浏览器，可视化的格式，允许多种输出格式，详细的VCF文件，读取文件的CpG单倍型为单等位基因甲基化分析，简化bedGraph，假发和床。

要求：

·的Java

此版本中的新功能：

·启用的输出低质量的CpG岛和参考CpG岛（不叫的CpG）cpg.raw.vcf文件。
·修复错误时显示有尝试错误的等位基因或以上的等位基因。
·修复的错误，调用的CpH非定向协议BS-seq的甲基化状态不正确的。