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AltAnalyze 2.0.6 / 2.0.8发展_AltAnalyze 2.0.6 / 2.0.8 Development软件简介

分析原始芯片的数据使用此工具

AltAnalyze是一个简单的,易于使用的开发的应用程序,让您,采取RNASeq或相对原始的基因芯片数据,确定预测的可变剪接或替代启动子的变化,并查看这些变化是如何影响蛋白质序列,结构域组成,microRNA的神器出山:www.shenqi73.com目标。

AltAnalyze与的任何RNASeq的数据,可以对准路口,有几个Affymetrix公司的拼接敏感数组类型(外显子基因1.0,1.0,结)以及许多传统的数组类型(例如,Affymetrix公司,Illumina公司,安捷伦)兼容。该软件需要先进的生物信息学知识的程序或脚本。所有你需要的是你的交界处读取文件或芯片以及一些简单的描述,你分析的条件。

此版本中的新功能:

·修正了大量漏洞(上市[FeaturesToImplement这里])
·多种新的辅助工具:3D PCA,标识符翻译,替代外显子浏览器,维恩图查看器,文件合并
·MarkerFinder算法,以独特的标记基因,每个条件
·可定制的层次聚类的可视化选项和相关的本体论/基因组/基因相关性/过滤选项
·WikiPathways基因值输入,无需可视化
·批处理效果正常化(战斗)
·支持安捷伦特征提取文件的规范化和分析
·额外的LineageProfiler分析选项
·网络可视化和分层聚类GO-精英的结果
此外,全基因组?Vista的TF网站预测GO-精英。

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软件简略信息
  • 软件大小:43.3 MB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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