先进的DNA序列分析生物信息学计划
CLC DNA Workbench提供了一个广泛的先进的DNA序列分析,是基于在同一个用户友好的和集成的软件环境为CLC免费工作平台。
下面是一个列表分析:
·大会的DNA测序数据
·图形和算法先进的神器出山:www.shenqi73.com引物设计
·分子克隆
·完全集成的一维DNA凝胶模拟器
·自动SNP序列的注释
·2种类型的对齐
·系统发育
·的Motif的搜索(已知的模式)
·母题使用正则表达式搜索
·母题搜索使用PROSITE模式
·模式发现(不明模式)
·基于Web的BLAST
·BLAST本地数据库
·批处理多重分析,在一个工作步骤
·点图
·疏水性分析
·搜索GenBank中医学
·行动/分析
在这里详细的日志“CLC DNA Workbench的”是一些主要特点:
生物信息学在DNA Workbench的功能:
·编辑图形和算法先进的引物设计
·大会的DNA序列数据
·分子克隆
·自动SNP序列的注释
·本地复杂的地区分析
·逆向翻译蛋白质的基因,转换表的基础上,从若干种
·先进的限制性内切酶分析和管理
·点图分析
·DNA统计报告在内的众多特性的分子
·NCBI序列数据搜索
·从医学
网络信息的访问
模式搜索:
·搜索序列匹配
·母题搜索的基本模式
·母题使用正则表达式搜索
·PROSITE图案母题“搜索
·模式发现(不明模式)
数据库检索:
·基于Web的顺序使用BLAST搜索
·BLAST本地数据库
·建立本地BLAST数据库
·GenBank中的Entrez搜索
·的UniProt搜索(SwissProt数据库/ TrEMBL的)
·医学查找
·基于Web的查询在UniProt,NCBI,而谷歌
·使用BLAST的SNP注释
项目和数据管理:
·完全集成的数据输入,数据管理,计算结果和数据导出
·详细的历史记录
·所有类型的
文件可以保存在本地的项目,并推出了从程序
在大量的文件格式导入和导出数据
·选项,能够同时工作在多个项目中工作的时间,在几个活跃的工作区
其他生物信息学的特点:
·DNA,RNA和蛋白质序列的编辑器中显示的直线和圆弧的分子
·多个对准的DNA,RNA和蛋白质的
·两个专有的算法
·CLUSTALW
·肌肉
·T-咖啡
·MAFFT
·Kalign
·加盟为一体的复合序列
·DNA,RNA和蛋白质的比对编辑器
·交互式标志沿两个DNA,RNA和蛋白质的路线图
·批量处理多个序列的分析,在一个工作步骤
·先进的重新调整和固定点对齐选项
·手动序列的注释
·点图分析
·本地复杂地区的分析和复杂性图
·峡部分图
·G / C含量分析和图表
·先进的两两比较
·提取注释
要求:
·要求,推荐使用512 MB RAM 256 MB RAM
·1024×768的屏幕分辨率
限制:
·30天试用版
·纳格屏幕本发行版中的新功能:
错误修正:
·所有元素显示在文件夹编辑器,防止错误是固定的。
·装饰用质量分数的文档已更新
·修正错误,防止重叠群在特殊情况下,手动编辑
·修复了各种错误