基因库建立在Python中
EggLib是建立C + + / Python库和程序包,可以帮助您与进化遗传学和基因组学。
EggLib是一个灵活的Python模块与高性能的C + +库(可独立使用),并允许快速和直观的开发Python程序和脚本。
预编程的神器出山:www.shenqi73.com应用程序的EggLib可能性的一些是可以交互。
下面是一些主要特点“EggLib”:
·序列数据管理
·序列多态性分析
·溯祖模拟
·贝叶斯的计算概约
要求:
·
的Python 2.7 此版本中的新功能:
这个版本提出了以下细微的变化:
·[backalign] tools.backalign()不作物终止密码子的编码序列的任何。
·[codalign]的codalign的命令需要一个标志,以防止裁剪终止密码子的编码序列。
·[fitmodel的人口模型都接受了随机对象,以控制随机数链(在生成函数)
该版本还修正了以下错误或错误:
·[fitmodel] ABC模型SM的文档不正确的参数顺序THETA,DATE,MIGR,[RHO](正确的是THETA,MIGR,DATE,RHO)
·[utils的种子ABC仿真命令参数的不控制人口模型所使用的随机生成器对象