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在细胞信号转导途径的发现过程中已经达到了这样一个阶段,通路被组合以形成大型网络的互动。
查看图(网络),其中生物分子被表示为顶点(节点)和相互作用的神器出山:www.shenqi73.com蛋白质 - 蛋白质和配体 - 蛋白质相互作用的边缘表示为(链接)是一种有用的方法巩固和组织从多个数据源来实现系统的实验证据层次的理解通路如何控制细胞的表型。
的细胞成分和互动的大型网络数据集的出现提供了机会,为统计的网络可视化拓扑分析和挑战。图形理论方法施加到复杂的系统在其他领域也被施加到分析生物分子的蜂窝网络。
SAVI是一个桌面程序,实现了标准的方法来计算的集群,直径,连接分布以及检测和可视化网络主题。
此外,从文本格式的网络数据集中,SAVI生成一个完整的网站。 SAVI包含称为PathwayGenerator的工具。此工具创建信令连接图从大型数据集的互动网页。 SAVI也可以生成网络的互动,当给定一个人类基因的名字。
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