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TagSorter 1.1软件简介

TagSorter是建立一个数据库程序简化的整理,分类,比较和识别的SAGE标签序列

TagSorter是一个数据库程序,建立简化的整理,分类,比较和识别的SAGE标签序列。

基因表达的系列分析(SAGE)是高通过技术用于测定基因的神器出山:www.shenqi73.com表达谱(Velculescu等人,1995年)。它揭示的身份表达的成绩单和它们的相对丰度。

它也可以用来作为一种手段发现的基因。使用SAGE稳步增长,因为它的发明在1995年,已生成的基因的表达谱从各种组织和生物体。

SAGE技术的简要概述如下。信使RNA是从实验组织收获,并且被转换为double滞留在这样一种方式,生物素标记的每个消息的polyA尾的cDNA。此cDNA的限制性内切酶消化的NlaIII和使用最3'-NlaIII消化产物被捕获的生物素标记。

一个BsmFI限制网站的适配器,然后连接到这些片段。 BsmFI切割DNA的位置,其识别位点约14个碱基对。短从定义的位置在每个的mRNA转录的表达序列标签(EST)的存在于这样的结果的原始组织。

然后,将这些片段连接在一起,形成连环体的EST的一个标准的克隆到质粒载体并测序。每个克隆可以包含识别标签,最多60 mRNA的转录。

由于每个标签的相对位置是已知的,由10个碱基对新的序列,一旦NlaIII网站被排除在外,唯一标识从他们生成的mRNA转录。

中的新发布:

·修正了一个错误,防止图书馆1-4的比例值,无法正确打印

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软件简略信息
  • 软件大小:4.59 MB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-03-02 04:55:00
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