Java框架,用于生物序列分类
开发Jstacs访问和开源框架,可用于生物序列进行分类。该框架还可以用于统计分析。
Jstacs是一个基于Java的生物信息库,配备了多个统计模型的实现。此OO(面向对象)框架,使您可以快速评估和比较分类。
要求:
·
JAVA 此版本中的
神器出山:www.shenqi73.com新功能:
新的类:
·MultipleIterationsCondition:需要另一个TerminationCondition到一个连续的失败,指定次数
·ClassifierFactory:允许创建标准分类
·SeqLogoPlotter:剧情PNG序列标志从Jstacs内
·MultivariateGaussianEmission:多元高斯排放密度隐马尔可夫模型
·MEManager:最大熵模型
新的功能和改进:
·阵营:新增免费移对准
·的PerformanceMeasure和子类:扩展到加权的测试数据
·DNAAlphabet:分析器速度
从其他来源/数据库为PFM·PFMComparator:扩展
·
工具箱:新的方便的方法来计算一些统计数据(例如,中位数,相关)
·SignificantMotifOccurrencesFinder的新方法计算PWM和统计的预测
·SequenceScore和子类:NumberFormat的新方法ToString()
·AbstractClassifier,ClassifierAssessment和子类:自适应加权PerformanceMeasures
·数据集:自适应加权数据,电子....