可靠和有用的工具,可以帮助您执行多系统发育分析,DNA和其他模拟使用动态同源性
POY是一个简单实用的系统发育分析程序,支持多种类型的数据,如核苷酸,基因和染色体。
POY特别是,它可以执行真正的神器出山:www.shenqi73.com对齐和亲缘关系推断(即输入序列不需要进行预校准)。插入,删除和重排,可以被包含在树的整体得分(下最大简约),或模型(下最大似然)。各种启发式算法已为此制定并实施POY。
此版本中的新功能:
新特点:
·报告愿为连理枝可能性字符,但
·简约分支长度不报告。新命令,允许打印
·分支长度从三个不同的方法(见下文),这些选项
·忽略的可能性,因为我们始终报告参数值,
·对数似然最大化。
·报告graphtrees,asciitrees,树木与可折叠财产有
·一直延伸到使用上述分支长度(参见命令
·下面的说明)。
·自定义的字母变换通过静态约静态特性。这
·是一个问题,可被表示为预对准的字符,并
·如何正确地变换它们之间。
·上架支持用于ocaml的PARMAP的产生成本固定状态矩阵。
·新增的指令报告(robinson_foulds)(请参阅下面的命令描述)
修正的错误:
·选择终端在ncurses造成的错误时显示,记录到一个
·不正确的窗口(路易丝·克劳利)。
·模型塞莱下的可能性转化...