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软件名称:[B]紫红色1.3.0_Mauve 1.3.0[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:5.08 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

紫红 - 多基因组序列比对。基因组序列的比较

紫红色是用于有效地构建大规模进化事件的存在下,如重排和反演的多个基因组对齐的系统。多个基因组比对研究,比较基因组学和进化动力学的研究上了一个全新的神器出山:www.shenqi73.com规模提供了依据。校准全基因组是根本不同的问题,而不是短序列对齐。

紫红色已开发的想法,多基因定位仪应该只需要适中的计算资源。它采用的算法技术,规模以及在排列的序列。例如,可以对鼠疫耶尔森氏菌基因组排列在一分钟之内,而一组9个不同的肠道细菌基因组可以在几个小时内保持一致。

此版本中的新功能:

·重排历史分析的广义换位/块交换,代码由麦克·蔡。使用绿/蓝/黑色的工具栏按钮来进行分析。 Yancopoulos,S.,Attie,O和弗里德伯格,R.推理算法的详细信息,请参阅“高效易位,倒位和块交换排序的基因组排列”生物信息学2005,21(16):3340-3346
·重排的历史,通过GRIMM / MGR服务器的支持,使用红/黄/黑色的工具栏按钮。
·没有更多的输入序列的数目限制。此功能来增加内存消耗的成本。仅仅因为限制已取消并不意味着会做一个很好的工作,处理了大量的序列比对算法。
·本mauveAligner的命令行工具的新选项 - LCB-的匹配输入到提取比赛从现有的校准和使用计算新的校准时,作为主持人。
·肌肉已经升级到3.6版。
·Mac OS X的版本是不...


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