软件名称：[B]AlleleID 6.01生成60103_AlleleID 6.01 Build 60103[/B]
软件类型：国产软件
运行环境：Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言：简体中文
授权方式：共享版
软件大小：43.5 MB
官方主页：Home Page
更新时间：2013-02-25 18:16:00
软件简介:

一个真正的时间q PCR引物和探针的设计工具，支持设计的寡核苷酸多序列比对。

AlleleID是一个全面的引物和探针设计软件的实时PCR /微阵列。该软件支持多个实时的TaqMan MGB TaqMan探针，分子信标，荧光共振能量转移（FRET），MLPA，Pamgene阵列和SYBR Green的神器出山:www.shenqi73.comPCR化学品，如。 AlleleID有多种算法，按照这些化学实验设计指引。

AlleleID允许用户输入他们的核苷酸序列，通过手动输入或从NCBI的Entrez下载。该软件还BLAST搜索序列，，解释这些搜索结果，避免了显着的交叉同源性。

AlleleID也没有一个的模板结构搜索，避免了在他们自己的地区，可以折叠。

用户可以设计出最佳的TaqMan探针，TaqMan MGB探针，分子信标，SYBR绿色的引物，MLPA探针和Pamgene探针免费的的二聚体，运行，重复和其他二级结构。

软件屏幕的寡核苷酸（包括引物和探针），熔融温度的要求，用户可以指定目标和公差值。寡核苷酸从来没有这些限制之外。因此，严格性和灵活性，完全是在用户手中。

该软件的显着特点是其设计能力，分析用于检测一组密切相关的序列的相似点和不同点。该软件支持多序列比对，使用CLUSTALW。

用户可以在程序中执行对齐，可以载入现有的校准文件。类群检测或跨物种放大或找到了一个物种的混合，无论是保守的区域，用户可以设计实验（引物和探针）。

该项目设计多重PCR引物和探针台（分析），用户可以选择一个他认为可能是最合适的。

该方案还可以从已公布业绩或成功的实验进行previoulsy评估寡核苷酸。该程序也可以找到合适的合作伙伴寡核苷酸引物和探针。

有一个选项，使用它用户可以导出的结果，他们的设计在csv文件。引物探针的设计结果也可以导出的格式的报告。

下面是一些主要特点“AlleleID”：

·实时PCR引物设计
·SYBR绿色引物设计
·TaqMan探针设计
分子信标设计
·FRET探针的设计
·芯片探针设计
·数据库支持
·输入和输出格式


要求：

·CPU：1.80 GHz的Pentium-IV的
·RAM：256 MB的可用内存
·硬盘空间：500 MB的可用硬盘空间
·屏幕分辨率：800 X 600


限制：

·有限公司提供的样本数据。

此版本中的新功能：

·可在MFOLD和NCBI BLAST服务器，包括支持最新的基因组数据库的最新变化。

[url=http://www.sot9.com/soft/63185.html][B]AlleleID 6.01生成60103_AlleleID 6.01 Build 60103[/B][/url]

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