在MAC5应用程序的设计是一个程序，它实现了MCMC抽样估计的进化树的DNA多序列比对。 有什么区别MAC5类似的计划是五年状态序列进化模型间隙信息的手段，包括估计的对齐时，它的使用。尽管在过去的文献中，这些模型的中伤，我们已经发现，在许多情况下，它们是有用的拓扑估计的精度提高。