软件名称:[B]SnoopCGH测试版发布_SnoopCGH Beta Release[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:14.8 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

基因组杂交数据浏览器。

SnoopCGH是一个Java桌面程序,旨在帮助您比较基因组杂交(CGH)的数据可视化和探索。

软件允许用户以交互方式的数据同时分析了多套。输入一个标签,空格或逗号分隔的神器出山:www.shenqi73.com格式,包含一系列的日志强度值对应一个或多个比较或样品。

SnoopCGH提供了CGH的情节无限放大(在两个轴),可以探索用鼠标交互。的多个层,可以层叠并结合,有利于使用的数据的可视化。这是可能的地积,以过滤CGH比或地区的利益进行统计分析,运用好几层。分析方法已经付诸实施,使快速可视化和公认的解剖结构的变化(SVS)。

特别是,数据进行平滑处理,使用Haar小波算法的基础上,估计SW-阵列的潜力颗卫星的岛屿。删除异常之前的估计增加鲁棒性,并估计水平的统计显着性和鲁棒性的假定颗卫星排列。假定状态变量此量化导致能力排列的关心区域。其他SV检测算法可以被集成在未来。

一个强大的功能,SnoopCGH接口与下载注释文件从基因组浏览器,包括基因名称和基因组功能的信息的能力。用户有一个可视化表示的注释脚下的情节和详细的文字信息可以很容易地访问,通过点击,或通过文本搜索。主要的基因组浏览器直接链接到注册成立。

要求:

·的Java


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