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按比例设计自动化的数据处理和分析的定量鸟枪蛋白质组学是一个简单的应用程序。定量鸟枪蛋白质组学试图估计蛋白质的丰度在相对于它们的丰度的参考单元中的处理单元。在这样的实验中,通过代谢标记,酶标记,或化学标记用稳定同位素标记的参考单元,被混合等量的治疗细胞。
蛋白质水解后,样本进行分析,多维液相色谱 - 串联质谱法。所获取的神器出山:www.shenqi73.com串联质谱用于识别的氨基酸序列,和翻译后修饰的蛋白水解肽。按比例需要的肽的鉴定结果和质谱的数据作为输入。在这一点上,
按比例将只接受作为识别结果和质谱数据在mzXML格式从程序DTASelect的输出。按比例将执行所有步骤蛋白的丰度比及其置信区间估计。这些步骤包括:提取选定的离子色谱,色谱峰的检测,肽丰度比的估计,估计的蛋白质丰度比。从每个这些步骤的结果,可以通过按比例的图形用户界面手动验证。