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软件名称:[B]WH[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:59.0 KB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

计算机程序执行的形态模型的拟合

WH是一个计算机程序进行装修的形态模型,该模型的拟合质量进行测试。形态模型被称为分离模式,和是没有基因流。通过比较DNA序列数据,每两个密切相关的物种,该方法允许的时间,因为祖先的形态和大小的估计。

神器出山:www.shenqi73.com隔离模型假定以下:
- 来自一个祖先,或人口,有一段时间,T代,在过去的两个物种,种群,已采样的数据,。
- 共同祖先的物种或种群是恒定的有效尺寸NA。
- 两个子代物种(群体)具有恒定的有效体积分别为N1和N2,。
- 除了在时间t的人口分离的时刻,人口的大小是恒定的。
- 由于人口的分离,是零的品种(群体)之间的基因流。
- 所有的基因突变是中性的。

应该驻留在同一文件夹中的数据文件,或由操作系统自动搜索文件夹中的程序文件。可以使用命令行参数运行程序,只需键入该程序的名称(WH)。如果不使用命令行参数,程序要求的运行参数的值。

用户启动程序只是简单地存在的数据文件所在的文件夹,输入该程序的名称(例如,“网站”),然后按回车键。该计划要求的数据文件和所需的分析的几个问题。几乎所有的命令和选项,也可以使用命令行参数输入。

程序可以被启动或在命令行的指令,而无需使用。
如果没有命令行指令 - 只需键入'WH'的提示。该计划将要求的基本信息。

在PowerPC上的程序图标,点击打开一个小窗口,在其中可以输入命令行参数。用户还可以只按回车键在这一点上,程序会要求运行参数。

命令行参数:

类型,并输入

WH-d'datafilename指定' - r'resultsfilename' - N'numsims“L'ldtype A'ranseed”

在哪里:

“datafilename”是在同一文件夹中的程序的数据文件的名称是

'resultsfilename'是包含结果将要创建的文件的名称。会产生结果文件名是'。WH'

'numsims'是一个整数的数目要运行的模拟。基本模型拟合不需要模拟。如果此值不为零或空白,数据文件必须有必要的信息,重组率。

“ldtype告诉程序是什么类型的连锁不平衡值计算。此选项需要做模拟,而且该数据文件包括对重组的信息和观察到的LD值。 “ldtype必须对应措施的连锁不平衡产生的数据文件。

'ldtype'可以取以下值:
'R'调用的相关系数
'S'调用R ^ 2,相关系数的平方
'D'调用基本配子的不平衡测量值d
'P'调用的D',这是等于D / Dmax的,其中,Dmax是给出的D所观察到的等位基因频率的最大可能值。
'B'调用的D的绝对值| D |

“ranseed'是一个随机数种子,一般不要求,除非用户希望完全重复模拟。


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