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DTscore应用程序的开发是基于串联重复树重构算法的距离。它是基于一个简单的串联重复模型,该模型假定不平等的重组(交叉)作为唯一的复制机制。
它作为输入的所有副本之间的神器出山:www.shenqi73.com距离矩阵。在此矩阵中,行和列作为副本的轨迹排列的,需要以相同的方式排列的。 DTscore可以适用于比较大的数据集(一百多份)。
距离可以使用程序,如DNADIST(碱基序列)或PROTDIST(蛋白质序列)从PHYLIP包计算。站点之间的取代的异构率可以处理使用的GAMMA方法,例如>
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