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软件名称:[B]汇集_Converge[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:48.0 KB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

收敛和平行进化的氨基酸序列水平上

应用程序的开发,测试在氨基酸序列水平上的收敛性和平行进化。计算所观察到的收敛性和并行替换的概率是由于偶然的机会。此套件包含一个程序:converg2.exe,这是用C语言编写。

要使用该程序,你需要一个输入文件,其中包含的神器出山:www.shenqi73.com氨基酸序列,这些序列和树的拓扑结构(见lysozyme.aa的例子)。此文件的开头两个数字:序列和氨基酸位点(序列长度)的数目的数目。

将第二行的第一序列的名称,将第三行的第一序列,并依此类推。只有一个字母的代码(大写)允许的20种氨基酸序列中。序列应当对准和间隙或任何其他的符号已经被移除。该文件的最后一行是树的拓扑结构的序列。的树格式作为PHYLIP包(费尔森斯丁1995)中所用的是相同的。需要注意的是无根树,所以硝化而比bification的需要为最深的分支节点。
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