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软件名称:[B]DNA龙1.1.9.1_DNA Dragon 1.1.9.1[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:486 KB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

DNA序列重叠群汇编软件

DNA龙是一种先进的DNA的工具,可以处理超过10万个样本的序列格式(FASTA,EMBL,GenBank登录号等)的跟踪文件格式(SCF,ABI,AB1)和下一代测序的文件格式(Illumina公司, SFF,GFF等)。

神器出山:www.shenqi73.com“DNA龙”注意:使用“许可证”按钮,在软件的试用版可以激活。

下面是一些主要特点:

·序列读取最流行的格式:(FASTA,GenBank登录,EMBL,SCF,ABI,AB1,社保基金理事会,下一代)。
·多重修剪功能:矢量,质量和长度的修剪。
·快速装配机处理项目超过10万个序列。

支持的文件格式:

项目文件:
·XML DNA龙的XML项目(*。XML)

序列文件格式:
·EMBL(*,EB *。EBI *。EMBL)
·序列(*。GB *。根;。序列*。TXT)
·FASTA(*。发; *。的FAS *。快。FASTA * FS;。金融服务局(fsa)。FSTA)

新一代测序的文件格式:
·ABI公司的SOLiD文件(*。GFF)
·固体CSFASTA文件(*。csfasta)
·公司Solexa紧凑型ASCII阅读的格式,围巾(S_ * _sequence.txt)
·Illumina公司_seq.txt文件(*。TXT)
·Illumina公司FASTQ文件(*。fastq)
“Illumina公司Qseq文件(* _qseq.txt)
·454标准flowgram文件,(*。SFF)

对齐的文件格式:
·序列比对/地图(SAM)格式(*。SAM)
·二进制对齐格式(*。BAM)(*。BAM)[中]

追踪文件格式:
·SCF(*。标准立方英尺)
·ABI(ABI; AB1)

导航树:
·A样品的导航树项目结构(重叠群和样本)很清楚。从此处的样本被选择,然后修剪和组装。

修剪和untrimming功能:
·入门限幅
·矢量的裁剪与自动pseudocircularization(50个碱基)。您可以检测假定向量图案序列中没有任何以前的知识。
·序列质量微调
·长度的修剪
·Untimming:恢复裁剪结束。

组装机和重叠群编辑:
·改变组装参数的各种选项可供选择。快速的,基于索引的装配序列自动排序的序列内的重叠群(偏移和装饰的目的),使项目管理的乐趣。
·校对的重叠群序列比对,即与他们的踪迹基地的比较,以及导出/复制的共识序列几乎是不言自明的。

限制:

·3个月试用


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