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HON-NEW应用程序设计为估计保守与激进的非同义编码蛋白质的DNA序列之间的距离。被修改的方法从休斯大田,和Nei原来的方法(1990)中,通过考虑过渡偏压。
三种类型的神器出山:www.shenqi73.com氨基酸分类(电荷,极性以及宫田和泰长)中所提供的。你也可以自行定义保守与激进的氨基酸的变化。
我们可以定义,使各组间的变化是激进的氨基酸组和组内的保守。要做到这一点,创造一个名为self.div。在这个文件中,在第一行应的基团的氨基酸(例如,在充电的情况下,有三组[ - ,0,+]),第二行是第一组中的氨基酸的数目,的空间,并在该组的氨基酸。
应使用的氨基酸的单字母代码。下一行是第二组的信息。人们只需要输入的信息的第一n-1基团,如果总共有n组,因为在最后一组的信息的第一n-1基团可以衍生自