软件名称：[B]AMMP 1.65[/B]
软件类型：国产软件
运行环境：Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言：简体中文
授权方式：共享版
软件大小：648 KB
官方主页：Home Page
更新时间：2013-02-25 18:16:00
软件简介:

一个现代化的功能齐全的分子力学

该的AMMP应用程序的开发是一个现代化的功能齐全的分子力学，动力学和模拟程序。它可以操纵两个小分子和大分子，包括蛋白质，核酸和其他聚合物。

除了标准的神器出山:www.shenqi73.com功能，如分子动力学数值稳定，快速多极在内的所有原子在远距离的潜力和强大的结构优化的计算方法，它具有灵活的潜力和选择一个简单而强大的能力来操纵分子和分析个人能源方面。

超过许多其他方案的一个主要优点是，它是容易引入非标准的聚合物之间的联系，不寻常的配位体或非标准残基。添加缺少的氢原子和完成部分结构的许多程序，这是很难的，简单的AMMP。

AMMP只有了解自己的语言。读取一个现有的坐标文件编译成AMMP语言。的：程序preammp（prewin）做这件事。可以运行在它自己Preammp，或从文件菜单中AMMP95。

Preammp需要几个输入。系统将提示您为他们每个人的Windows文件选择菜单。如果你不喜欢这样，只需取消窗口的prewin男人“窗口中输入文件名，（这是简单的做，而不是描述！）。当你不有一个文件，如当从头开始的坐标，您需要取消Windows文件选择菜单，然后进入主窗口的回报。

preammp只能在一个时间的一个残基。聚合物中，您将需要提供INTERMONOMER联动。提供的脚本，如peplink.amp（蛋白质）和ndick.amp的（标准DNA / RNA联动）。这些生成的，生成模板的二聚体和提取相应的条款。他们也来看看如何操纵原子和潜力的自动脚本的好地方。

要创建一个新的分子，你必须先定义一个模板。然后，运行preammp。当preammp要求的坐标集不输入任何文件名。不同于与现有的分子的情况下，将无法preammp自动查找从坐标分子种。所以，你会被提示输入一个分子的名字。这是仅限于三个字符放入PDB格式。 （很抱歉，但是这是怎么回事）。

[url=http://www.sot9.com/soft/65728.html][B]AMMP 1.65[/B][/url]

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