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在何种程度上的氨基酸的站点是自由变化强烈地依赖于它的结构和功能的重要性。一种氨基酸,起着至关重要的作用,如在活动现场的蛋白质之一,是不可能改变的,在进化的过程。
因此,在的神器出山:www.shenqi73.com氨基酸位点的进化速率是表示这个站点是保守的,并且反过来,允许在维持该蛋白质的结构或功能的重要性,此网站评价。
McRate是一个方便,易于使用的工具,专门设计的计算相对进化速率在每个站点使用基于概率的进化模式。这使得考虑到随机过程的基本演化序列内的蛋白质家族。
最重要的是,McRate利用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法,整合所有可能的树的空间。因此,McRate不假设根据该序列与预先存在的系统发育树。 McRate被认为是优于NA五个方法,仅依靠一个单一的树。