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ProtSeqFetch是一个小的,基于Java的应用程序,旨在帮助您下载蛋白质序列从NCBI或NR数据库。
该软件提供了这些工具:
下载序列数据:
两个选项是提供给NCBI或NR文件下载序列数据。
上传生物名单:
两个选项是提供给用户上载的神器出山:www.shenqi73.com生物名单。一种是通过键盘在文本框输入的有机体。第二种方法是通过选择一个文件,包含生物体列表。
这些序列被下载到nrSequencesI.fa文件的下载目录。如果任何多余的序列被发现,他们保存到redSequences.fa文件。
下载NR资料库:
此功能提供了NR数据库用户下载,从NCBI到本地系统。总共有4份nr.00 nr.03可供下载。用户需要输入部分下载(从0到3)。每个文件的大小大约是800 MB。可能需要几个小时才能下载您的互联网速度的基础上。
检查生物体:
此实用程序可用于检查给定的有机体名称连接到NCBI和验证的正确性。