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NGSTools是一个基于Java的包的目的是提供一个对象模型,使不同类型的新一代测序数据的分析。
该软件包还提供了一些实用程序来读取不同的参考基因组对齐。此包中最重要的工具SNVQ,准确的神器出山:www.shenqi73.com单核苷酸变异(SNV)的检测和基因分型算法从基本通话和质量得分和合并规则集的读取比对相同的路线,一个的CCDS成绩单库中读取参考组装。
在此程序包中的每一个工具选择的格式处理的路线是SAM,让,整合NGSTools常用的映射方案的蝴蝶结和其他分析软件包,如SAMTools。