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软件名称:[B]CMView 1.1.1[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:8.01 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

联系方式电子地图的可视化变得容易

CMView是一个方便,易于使用的,基于Java的交互地图可视化和分析应用。

CMView是一个软件工具,用于可视化和分析的蛋白质结构中的氨基酸残基之间的接触网络

形式上,这网络是一个曲线图,其中每个残基对应于一个节点,并且当且仅当由边缘的神器出山:www.shenqi73.com两个残基是在接触的两个节点连接。两个残基被认为是接触的,如果它们在空间上接近的三维结构中。

在接触的定义CMView指定由两个paremeters:接触型和距离截止。接触类型定义的一个子集的残余物的原子。然后,两个残基i和j是接触的,如果两个原子满分这个子集,从i之一和一个从j,都没有进一步分开的距离比截止。

描绘的接触作为一个矩阵(正式地说,接触图的邻接矩阵的)网络被称为接触地图。

下面是一些主要特点“CMView”:

路联合联络图和三维结构图(使用PyMOL)
路各种IM和出口选项:PDB文件,在线PDB,图像导出,CASP预测格式和其他
路计算与用户定义的接触定义接触地图
路功能丰富的3D分子可视化集成利用PyMOL
使用内置的序列或结构比对的路的结构和联络图比较
路距离的地图,不同的地图,接触密度分析

要求:

的Java


[url=http://www.sot9.com/soft/67446.html][B]CMView 1.1.1[/B][/url]

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