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ProDGe(蛋白质结构域的基因)的可视化,并提出新的域名 - 域名在域级别上的相互作用和蛋白质 - 蛋白质相互作用。
背后ProDGe包括蛋白质,域名和互动两个层,收集信息,并结合适当的神器出山:www.shenqi73.comUniProt,PFAM,DOMINE和完整的综合数据集。
基于对已知域相互作用,ProDGe建议新的蛋白质的相互作用,将它们分配给四个置信类,取决于底层域相互作用的可靠性。
此外,ProDGe是能够识别潜在的合作伙伴在其他物种中同源的互动,这是特别有用调查不良注明的物种时,。
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