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jCompoundMapper化学图,以提供流行的指纹识别算法。在这个图表中,我们可以找到的深度优先搜索指纹,最短路径指纹,扩展连接指纹,自相关指纹(例如CATS2D),径向指纹(例如Molprint2D),Molprint几何,原子对,和药效指纹。
jCompoundMapper提供了多种格式的神器出山:www.shenqi73.com机器学习工具,如LIBSVM中,LIBLINEAR的,和WEKA的出口商。
该应用程序允许这样的参数化搜索深度,距离切销或原子打字。在散列的指纹的情况下,你可以配置的哈希空间的大小。
jCompoundMapper相似矩阵的聚类方法的计算或输入格式LIBSVM
该软件可以作为一个轻量级的的jar库或独立可执行文件
jCompoundMapper完全基于开放源码软件以开放的许可证。它使用的化学专家系统的的化学开发工具包。
该计划的主要目标是:
·提供标准的指纹实现数据挖掘实验
·开源实现用一个确切的定义
·易于使用的命令行工具,用于所描述的任务
·提供可以比较,例如完全相同的标记算法,算法的基础,发展新的指纹编码。