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这个工具的帮助下,
CViT,染色体查看工具被设计成一个Perl的应用程序,可以用于快速生成PNG图像显示的各种地图或基因组序列的功能。
它是故意简单和非交互式的,虽然它是可以包裹CViT里面,例如,交互式网页。
输入包含在GFF3格式中的神器出山:www.shenqi73.com一个或多个数据文件。该数据必须包含描述一个或多个“染色体”(这可能代表一个连接基团,psuedomolecule,BAC,重叠群,任何形式的连续的伸展的DNA,或什至一种蛋白质结构)的记录。
这些“染色体”的功能被放置在骨干。 CViT将显示连续的坐标系统,包括碱基对,centiMorgans(遗传图谱)和centiMcClintoks(细胞遗传学图)。的坐标向前跑(最小到最大)或向后(最大到smalles)。
输出包括一个PNG图像的染色体(S)和功能,一个传奇的形象,和一个列表的功能坐标。