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PROTML是一个主要在MOLPHY方案,从蛋白质(氨基酸)序列的进化树推断,使用最大似然法。
MOLPHY包括几个方案,即:
PROTML:最大似然推理的蛋白质系统发育
NUCML:最大似然推理的神器出山:www.shenqi73.com核酸系统发育
PROTST蛋白质序列的基本情况:
NUCST:核酸序列的基本情况
NJDIST:邻接系统发育从距离矩阵