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的BlastAlign的应用程序使用NCBI BLAST调整有大INDELS,(插入/缺失),或因其他原因难以对齐全球范围内的核苷酸序列。
该计划选择最有代表性的序列输入序列,然后提取高炉查询,挂靠多序列比对(NEXUS与PHYLIP格式)。或者,用户可以选择使用哪一个序列作为一个锚。
该方案还输出一个矩阵代表沿的神器出山:www.shenqi73.com序列,它可以用来直观地识别分组共享尤其是大型INDELS区域的同源性。一个额外的程序,BlastAlignP使用TBLASTN对齐到一个单一的氨基酸参考序列的核苷酸序列,使得在多个对准